Rapid prediction of solvation free energy. 3. Application to the SAMPL2 challenge
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Rapid prediction of solvation free energy. 3. Application to the SAMPL2 challenge
The SAMPL2 hydration free energy blind prediction challenge consisted of a data set of 41 molecules divided into three subsets: explanatory, obscure and investigatory, where experimental hydration free energies were given for the explanatory, withheld for the obscure, and not known for the investigatory molecules. We employed two solvation models for this challenge, a linear interaction energy ...
متن کاملPrediction of SAMPL2 aqueous solvation free energies and tautomeric ratios using the SM8, SM8AD, and SMD solvation models
We applied the solvation models SM8, SM8AD, and SMD in combination with the Minnesota M06-2X density functional to predict vacuum-water transfer free energies (Task 1) and tautomeric ratios in aqueous solution (Task 2) for the SAMPL2 test set. The bulk-electrostatic contribution to the free energy of solvation is treated as follows: SM8 employs the generalized Born model with the Coulomb field ...
متن کاملthe role of russia in transmission of energy from central asia and caucuses to european union
پس ازفروپاشی شوروی،رشد منابع نفت و گاز، آسیای میانه و قفقاز را در یک بازی ژئوپلتیکی انرژی قرار داده است. با در نظر گرفتن این منابع هیدروکربنی، این منطقه به یک میدانجنگ و رقابت تجاری برای بازی های ژئوپلتیکی قدرت های بزرگ جهانی تبدیل شده است. روسیه منطقه را به عنوان حیات خلوت خود تلقی نموده و علاقمند به حفظ حضورش می باشد تا همانند گذشته گاز طبیعی را به وسیله خط لوله مرکزی دریافت و به عنوان یک واس...
15 صفحه اولContinuous medium theory for nonequilibrium solvation: I. How to correctly evaluate solvation free energy of nonequilibrium
Considering the influences of electrostatic potential Phi upon the change of solute charge distribution deltarho and rho upon the change deltaPhi at the same time, a more reasonable integral formula of dG = (1/2) integral (V) (rhodeltaPhi + Phideltarho)dV is used to calculate the change of the electrostatic free energy in charging the solute-solvent system to a nonequilibrium state, instead of ...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Journal of Computer-Aided Molecular Design
سال: 2010
ISSN: 0920-654X,1573-4951
DOI: 10.1007/s10822-010-9341-9